Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Szrd1Q6NXN1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Szrd1Q6NXN1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms