Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ScapQ6GQT6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ScapQ6GQT6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms