Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc3c1Q6DFV6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc3c1Q6DFV6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms