Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rftn1Q6A0D4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rftn1Q6A0D4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms