Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Thsd7aQ69ZU6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Thsd7aQ69ZU6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms