Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg9aQ68FE2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg9aQ68FE2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg9aQ68FE2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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