Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt12Q64291 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms