Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm1Q60636 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms