Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fam20cQ5MJS3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fam20cQ5MJS3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms