Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb3Q571F5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms