Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl4Q3URY0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rtl4Q3URY0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 511.2 ms