Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
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Uspl1Q3ULM6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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Uspl1Q3ULM6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uspl1Q3ULM6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
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Uspl1Q3ULM6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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Uspl1Q3ULM6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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Uspl1Q3ULM6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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Uspl1Q3ULM6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
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Uspl1Q3ULM6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Uspl1Q3ULM6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms