Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brf2Q3UAW9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brf2Q3UAW9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms