Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk3Q3U3Q1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms