Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd11Q1RNF8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.6 ms