Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Caprin2Q05A80 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Caprin2Q05A80 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms