Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sdr16c6Q05A13 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms