Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sox12Q04890 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms