Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmklr1P97468 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmklr1P97468 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmklr1P97468 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmklr1P97468 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmklr1P97468 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmklr1P97468 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmklr1P97468 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmklr1P97468 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmklr1P97468 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmklr1P97468 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmklr1P97468 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmklr1P97468 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmklr1P97468 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmklr1P97468 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmklr1P97468 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmklr1P97468 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmklr1P97468 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms