Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf1bP97358 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Taf1bP97358 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1bP97358 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.1 ms