Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd13P70217 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd13P70217 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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