Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2mP61082 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2mP61082 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms