Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox5P52651 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox5P52651 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms