Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb41P48193 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb41P48193 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb41P48193 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epb41P48193 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb41P48193 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb41P48193 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb41P48193 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb41P48193 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb41P48193 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb41P48193 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms