Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cdkn1bP46414 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms