Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf1P46099 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf1P46099 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf1P46099 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf1P46099 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf1P46099 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Klf1P46099 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klf1P46099 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms