Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kif3aP28741 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif3aP28741 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms