Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spi1P17433 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spi1P17433 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spi1P17433 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spi1P17433 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spi1P17433 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spi1P17433 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms