Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FlgP11088 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FlgP11088 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FlgP11088 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FlgP11088 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FlgP11088 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FlgP11088 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FlgP11088 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FlgP11088 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FlgP11088 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FlgP11088 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FlgP11088 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FlgP11088 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FlgP11088 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FlgP11088 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FlgP11088 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FlgP11088 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FlgP11088 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FlgP11088 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FlgP11088 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FlgP11088 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FlgP11088 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FlgP11088 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FlgP11088 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FlgP11088 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FlgP11088 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FlgP11088 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FlgP11088 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FlgP11088 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FlgP11088 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FlgP11088 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FlgP11088 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FlgP11088 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FlgP11088 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FlgP11088 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FlgP11088 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FlgP11088 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FlgP11088 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FlgP11088 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FlgP11088 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FlgP11088 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FlgP11088 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FlgP11088 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FlgP11088 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FlgP11088 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FlgP11088 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FlgP11088 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FlgP11088 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FlgP11088 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FlgP11088 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FlgP11088 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FlgP11088 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FlgP11088 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FlgP11088 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FlgP11088 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FlgP11088 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FlgP11088 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FlgP11088 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FlgP11088 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FlgP11088 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FlgP11088 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FlgP11088 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FlgP11088 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FlgP11088 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FlgP11088 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FlgP11088 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FlgP11088 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FlgP11088 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FlgP11088 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FlgP11088 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FlgP11088 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FlgP11088 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FlgP11088 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FlgP11088 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FlgP11088 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FlgP11088 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FlgP11088 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FlgP11088 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FlgP11088 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FlgP11088 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FlgP11088 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FlgP11088 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FlgP11088 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FlgP11088 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FlgP11088 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FlgP11088 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FlgP11088 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FlgP11088 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FlgP11088 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FlgP11088 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FlgP11088 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FlgP11088 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FlgP11088 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FlgP11088 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FlgP11088 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FlgP11088 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FlgP11088 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FlgP11088 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FlgP11088 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FlgP11088 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms