Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2aP08775 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2aP08775 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2aP08775 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms