Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01797 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01797 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01797 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01797 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01797 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01797 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01797 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01797 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01797 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01797 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01797 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01797 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01797 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01797 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01797 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01797 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01797 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01797 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01797 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01797 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01797 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01797 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01797 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01797 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01797 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01797 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01797 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01797 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01797 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01797 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01797 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01797 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01797 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01797 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01797 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01797 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01797 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01797 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01797 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01797 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01797 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01797 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01797 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01797 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01797 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01797 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01797 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01797 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01797 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01797 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01797 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01797 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01797 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01797 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01797 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01797 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01797 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01797 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01797 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01797 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01797 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01797 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01797 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01797 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01797 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01797 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01797 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01797 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01797 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01797 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01797 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01797 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01797 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01797 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01797 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01797 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01797 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01797 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01797 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms