Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01725 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01725 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01725 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01725 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01725 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01725 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01725 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01725 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01725 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01725 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01725 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01725 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01725 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01725 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01725 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01725 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01725 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01725 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01725 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01725 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01725 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01725 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01725 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01725 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01725 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01725 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01725 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01725 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01725 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01725 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01725 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01725 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01725 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01725 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01725 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01725 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01725 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01725 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01725 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01725 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01725 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01725 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01725 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01725 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01725 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01725 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01725 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01725 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01725 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01725 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01725 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01725 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01725 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01725 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01725 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01725 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01725 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01725 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01725 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01725 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01725 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01725 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01725 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01725 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01725 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01725 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01725 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01725 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01725 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01725 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01725 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01725 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01725 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01725 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01725 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01725 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01725 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01725 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01725 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms