Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01678 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01678 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
P01678 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
P01678 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01678 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01678 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01678 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01678 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01678 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01678 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
P01678 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01678 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01678 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01678 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01678 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01678 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01678 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01678 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
P01678 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01678 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01678 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01678 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01678 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01678 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01678 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
P01678 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01678 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01678 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01678 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01678 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01678 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01678 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01678 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01678 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01678 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01678 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01678 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01678 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01678 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01678 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01678 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01678 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01678 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01678 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01678 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01678 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01678 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
P01678 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01678 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01678 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01678 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01678 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01678 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01678 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
P01678 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
P01678 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01678 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01678 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01678 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01678 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01678 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01678 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01678 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01678 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01678 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01678 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01678 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01678 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01678 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01678 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01678 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01678 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01678 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01678 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01678 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01678 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01678 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01678 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01678 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01678 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01678 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01678 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01678 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01678 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
P01678 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01678 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01678 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01678 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01678 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01678 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01678 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01678 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01678 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01678 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01678 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01678 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01678 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01678 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01678 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms