Protein–RNA interactions for Protein: P01657

Ig kappa chain V-III region PC 2413, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01657 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01657 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01657 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01657 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01657 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01657 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01657 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01657 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01657 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01657 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01657 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01657 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01657 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01657 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01657 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01657 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01657 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01657 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01657 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01657 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01657 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01657 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01657 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01657 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01657 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01657 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01657 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01657 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01657 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01657 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01657 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01657 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01657 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01657 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01657 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01657 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01657 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01657 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01657 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01657 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01657 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01657 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01657 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01657 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01657 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01657 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01657 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01657 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01657 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01657 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01657 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01657 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01657 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01657 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01657 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01657 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P01657 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01657 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01657 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01657 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P01657 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01657 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01657 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01657 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01657 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01657 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P01657 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01657 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01657 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01657 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01657 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01657 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01657 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01657 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01657 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01657 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01657 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01657 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01657 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01657 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01657 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01657 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01657 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01657 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01657 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01657 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01657 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01657 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01657 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01657 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01657 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01657 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01657 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01657 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01657 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P01657 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01657 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01657 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01657 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01657 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms