Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vamp4O70480 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vamp4O70480 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms