Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2f6O54917 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2f6O54917 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2f6O54917 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f6O54917 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2f6O54917 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 818.6 ms