Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf5O35445 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf5O35445 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf5O35445 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms