Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-ObO35424 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-ObO35424 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-ObO35424 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms