Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mfsd4b4J3QNS5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms