Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem200cJ3QK46 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms