Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1iE9Q7P2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms