Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trappc8E9PWG2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trappc8E9PWG2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trappc8E9PWG2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms