Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprbB2RU80 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprbB2RU80 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms