Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp42B2RQC2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms