Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Svep1A2AVA0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Svep1A2AVA0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms