Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hacd4A2AKM2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms