Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdc27A2A6Q5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc27A2A6Q5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 219.2 ms