Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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