Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Knop1Q9Z2Q2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Knop1Q9Z2Q2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms