Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syt6Q9R0N8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syt6Q9R0N8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Syt6Q9R0N8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syt6Q9R0N8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syt6Q9R0N8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syt6Q9R0N8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syt6Q9R0N8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syt6Q9R0N8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syt6Q9R0N8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syt6Q9R0N8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syt6Q9R0N8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syt6Q9R0N8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syt6Q9R0N8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syt6Q9R0N8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syt6Q9R0N8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syt6Q9R0N8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syt6Q9R0N8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syt6Q9R0N8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms